Помощник-пилот на авиокомпания „Флайдубай“ нападна командира на самолета по време на полет от Дубай за Тел Авив на 30 септември, съобщи прокуратурата на Обединените арабски емирства, цитирана от БТА. Според първоначалните информации нападателят е използвал брадва от аварийното оборудване на самолета. Други източници обаче съобщават, че е използвал нож. Разследващите в ОАЕ разглеждат инцидента като предполагаем опит за терористична атака.
Самолетът, полет FZ1073, започнал рязко да губи височина след нападението. Командирът, индийски гражданин, бил тежко ранен, но успял да отвори вратата на пилотската кабина, което позволило на пътници и членове на екипажа да обезвредят нападателя. Машината извършила аварийно кацане в Табук, Саудитска Арабия.
Вторият пилот, който според израелски източници е гражданин на Оман, е идентифициран като Хамам ал Хамами. Той е бил отведен в ОАЕ. Според публикации на саудитската телевизия „Ал Арабия“, CNN, ABC и „Уолстрийт джърнъл“ на втория пилот е било забранено да лети от властите в Оман, които са го подозирали в радикализация. Баща му е от Оман, а майка му – сирийка. Преди да се присъедини към „Флайдубай“, той е работил за „Оман Еър“ и е кандидатствал безуспешно за работа в „Емирейтс“.
Израелският премиер Бенямин Нетаняху заяви, че нападателят е претърпял ислямистка радикализация и е имал намерение да разбие самолета заедно с пътниците. Разследването в ОАЕ продължава, като властите се опитват да установят мотивите и евентуалните връзки на нападателя.
Според разкази на двама пътници пред The New York Post някои членове на кабинния екипаж настоявали вторият пилот да бъде освободен, след като трима пътници го обезвредили и вързали. „Те ни молеха да развържем терориста — не разбирахме защо“, разказал Цвика Манес, един от пътниците, намесили се при нападението. Манес, Янив Хаюн и Асаф Раджуан успели да задържат втория пилот, като първоначално използвали пластмасови стяжки, а след това и кабели от слушалки, събрани от други пътници. По думите на Манес членовете на екипажа им казали: „Вие не сте Бог, не можете да го убиете“.
Поведението на стюардите предизвикало подозрения сред част от пътниците. Те настояли екипажът да се отдалечи от пилотската кабина и да се премести в петия или шестия ред. „Казахме им: „Сега ние командваме и ще правите каквото ви казваме“, разказал Манес. По-късно, според пътника Даниел Шлихтер, членовете на екипажа започнали да помагат, като раздавали вода и одеяла. Няма данни екипажът да е обвинен в съучастие с втория пилот.